タイリングアレイによる網羅的DNAメチル化検出法を開発

ゲノムサイエンス研究室の林研究員、堤助手らはゲノムタイリングアレイを用いて網羅的にDNAメチル化を検出する方法をHuman Genetics誌に発表しました。抗メチルシトシン抗体を用いた免疫沈降によりメチル化DNAを濃縮し(MeDIP)、タイリングアレイでメチル化部位を検出するMeDIP-chip法によりヒトゲノム中に1万箇所以上あるメチル化部位の検出が可能になります。

また、同時にChIP-chip法によりヒストンH3およびH4のアセチル化を解析することによりゲノムメチル化とは相反して存在する傾向が認められました。なお、本研究は主に文部科学省科学研究費補助金により行われました。

Hayashi H, Nagae G, Tsutsumi S, Kaneshiro K, Kozaki T, Kaneda A, Sugisaki H, Aburatani H.
High-resolution mapping of DNA methylation in human genome using oligonucleotide tiling array.
Hum Genet. 2006 Sep 26; [Epub ahead of print] PMID: 17024368

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