投稿者「Shiro Fukuda」のアーカイブ
タイリングアレイによるP53結合とヒストンアセチル化修飾の関係を解明
ゲノムサイエンス研究室の金城研究員と堤助手はゲノムタイリングアレイを用いて癌抑制遺伝子p53のゲノム結合部位の同定およびp53結合依存性に生じるヒストンアセチル化修飾に関する解析結果をGenomic誌に発表しました。抗p … 続きを読む
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タイリングアレイによる網羅的DNAメチル化検出法を開発
ゲノムサイエンス研究室の林研究員、堤助手らはゲノムタイリングアレイを用いて網羅的にDNAメチル化を検出する方法をHuman Genetics誌に発表しました。抗メチルシトシン抗体を用いた免疫沈降によりメチル化DNAを濃縮 … 続きを読む
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Txnip遺伝子変異マウスにおける肝発癌
UCLAのLusis研究室との共同でマウスの肝細胞癌モデルについて解析しました。 thioredoxin interacting protein (Txnip)は混合型家族性高脂血症のモデルマウスと考えられるHcB-19 … 続きを読む
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SNPタイピングアレイを用いたゲノムコピー数解析のノイズ低減の手法を開発
SNPタイピングアレイを用いたゲノムコピー数解析においては、2つのマイクロアレイシグナルを比較するために、実験条件の違いにより生じるノイズが大きな問題となっていました。 本論文では、プローブ配列や制限酵素断片の配列に関連 … 続きを読む
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肝細胞癌のmolecular karyotyping
肝発癌における染色体変異を解析し責任候補遺伝子を同定する目的で、当研究室が先に開発したゲノムインバランスマップ(GIM)(Ishikawa 2005)を用いて、36例の原発性肝細胞癌について高密度マッピングアレイによる解 … 続きを読む
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